تتولى المديرية ممارسة الأعمال المناطة بها المتعلقة بالمديرية العامة للموانئ وتعمل على مساعدة الإدارة والمديريات الأخرى وتقديم الخدمات الإدارية للعاملين وفق أحكام القانون وتحقق أهدافها من خلال :

الدائرة المالية:

تقوم بإعداد الموازنة للعمليات الجارية وقبض الرسوم من البواخر الأجنبية التي تؤم الموانئ السورية , كما تقوم بإعداد دفاتر الشروط المالية والحقوقية وإعداد الإعلانات الخاصة بكافة المشاريع الداخلية والخارجية وفتح الأضابير الخاصة بها وتنظيم محاضر الجلسات للجان العقود والمناقصات , كما تقوم بتنظيم مع العروض الفائزة ومتابعة إجراءات تصديق هذه العقود من المراجع المختصة ومتابعة إجراءات تخصيص القطع الأجنبي إذا كان العقد مبرم مع شركات أجنبية وكذلك متابعة إجراءات الحصول على إجازات الاستيراد وفتح الاعتماد المستندي لدى المصارف.
تقترح الطلب إلى الشركات الأجنبية التي ترغب في الاشتراك بعروض الأسعار أن تكون عروضها مستوفية لكافة الشروط الواردة في دفاترالشروط الفنية والمالية والحقوقية حتى لا تضطر الإدارة إلى مراسلة هذه الشركات الأمر الذي يؤدي إلى إطالة فترة دراسة العروض وبالتاليتأخير مدة إنجاز الدراسة وتنظيم العقد.

الدائرة القانونية:

المهمة الأساسية التي تقوم بها الدائرة المذكورة هي :

• الدفاع عن حقوق المديرية العامة للموانئ استناداً للقوانين والأنظمة النافذة بعد دراسة ومناقشة الوثائق والمعطيات وفق الأدلة الخاصة بالمواضيع المطروحة وتقديم الدفوع اللازمة على هذا الأساس لإدارة قضايا الدولة لطرحها أثناء المرافعة بالدعوى.
• متابعة القضايا والدعاوى لدى إدارة قضايا الدولة بفرعيها طرطوس واللاذقية لمعرفة المصير والمرحلة التي وصلت إليها هذه الدعاوى.
• تقديم المشورة والرأي القانوني من خلال المواضيع المطروح للمديرية وفق القوانين والمراسيم النافذة.
• تفعيل هذه الدائرة بإدخال كافة الدعاوى والمواضيع القانونية وبرمجتها بالرقم والتاريخ والاسم دون التدخل بالموضوع لأن سرية موضوع الدعوى واجبة.

الدائرة الإدارية:

• تتولى القيام بجميع الأعمال الإدارية المتعلقة بشؤون العاملين ومراقبة دوامهم و أوضاعهم الوظيفية.
• تنفيذ الأحكام الواردة في القانون الأساسي للعاملين في الدولة والتعليمات الصادرة بهذا الشأن.
• معالجة شؤون العاملين في المديرية العامة وإعداد مشاريع الصكوك المتعلقة بأوضاعهم الوظيفية في مختلف حالاتها وكل ما يتعلق بترفيعهم وفقاً للقوانين والأنظمة النافذة.
• القيام بكل ما يتعلق بإجراءات التعيين المنصوص عنها بالقانون الأساسي للعاملين.

دائرة الديوان:

• يقوم الديوان باستلام كافة المعاملات الواردة إلى المديرية العامة وتسجيلها وتوزيعها على الإدارات المختصة وإرسال المعاملات الصادرةإلى وجهتها والإشراف على أعمال السحب والتصوير كما يتولى حفظ المستندات ومسك السجلات والقيود والتصنيف والخاتم العام للمديريةالعامة ونسخ كافة المراسلات الصادرة والبرقيات والهواتف المسجلة .
• مسك السجلات ودفاتر دليل الأرشيف والقيام بأعمال التصنيف وفق التعليمات الموضوعة لذلك.
• المحافظة على الآلات الكاتبة والتصوير وتأمين صيانتها و إصلاحها لضمان استمرار العمل بها وتعمل من خلال الشعبتين التاليتين:
  1- شعبة المراسلات والأرشيف .
  2- شعبة النسخ والتصوير.